Dalam manga Naruto, desa para shinobi (忍の里) atau desa-desa tersembunyi (隠れ里) adalah desa-desa ninja yang berperan sebagai kekuatan militer untuk negara mereka. Desa desa ini disebut desa tersembunyi
karena berada jauh dari pusat peradaban negara tempat desa itu berada. Setiap negara menaungi satu desa; contohnya Konohagakure dinaungi negeri api. Nama desa dan negeri yang menaungi mereka tidak selalu sama, contohnya negeri api menaungi desa daun, negeri angin-desa pasir, negeri air-desa kabut, negeri petir-desa awan dan desa tanah menaungi desa batu. Setiap desa tersembunyi menjaga perekonomiannya
dengan melatih warga negaranya untuk menjadi ninja mulai dari usia kecil. Mereka digunakan sebagai kekuatan dalam berbagai misi, yang kemudian, mereka akan dibayar setiap kali melakukan misi-misi tersebut, dari mencabuti rumput liar untuk sebuah single payment hingga 'gaji tetap' dari negara dimana mereka tinggal apabila mereka menjadi tentara ketika seandainya negara terlibat perang. Desa-desa tersembunyi di lima negara utama dipimpin oleh seorang Kage.
Daftar desa tersembunyi:
Konohagakure
Selama ini yang memimpin desa Konoha adalah Tsunade, Hokage Kelima sekaligus legenda sannin dari 3 legenda sanin. Dia adalah cucu dari Hokage Pertama, dan murid dari Hokage Ketiga (Sarutobi). Desa konoha adalah desa yang subur dan makmur, dan banyak menciptakan para shinobi yang kuat. Sejak penyerbuan Orochimaru dan para ninja serta shinobi Suna, Konoha mulai berusaha dengan keras untuk membenahi desa, apalagi sejak Hokage ketiga wafat, Konoha mulai membenahi dirinya dan juga memeperketat penjagaan.
Konoha mulai dikenal karena Hokagenya; mereka mempunyai cerita sendiri yang sangat terkenal; yang pertama adalah cerita tentang Hokage Pertama, dia adalah orang yang bisa mengalahkan Madara Uchiha nenek moyang klan Uchiha. Madara sebenarnya sahabat Hokage Pertama yang sama-sama membangun konoha tapi pola pikiran mereka sangat berbeda. madara adalah moyang klan uchiha yang dimana keistimewaan klan ini antara lain mamapu mengontrol kyuubi sehingga mamapu mengatur kyubi memenggil dan menghilangkannya. dahulu juga madara yang di khianati oleh hokage pertama dalam pengembangan desa memanggil kyuubi untuk memeporakporandakan konoha. namun ia masih hidup dan bergabung dengan akatsuki dengan nama tobi. karena itu melihat uchiha yang bertentangan olah pikiran dengan konoha lain, maka hokage ketiga menyuruh itachi uchiha agar membunuh semua klan uchiha, itachi yang merupakan penghubung antar klan terintimidasi dan bersedia hingga membunuh semua klannya, namun menyisakan satu orang yaitu sasuke. tujuannya agar sasuke menjadi kuat untuk memebalas dendam keluarga. Sasuke yang mengetahui itachi memebunuh dengan terpaksa akhirnya diberi "mata elang" oleh itachi saat mereka bertempur di akhir hidup itachi baru-baru ini. sasuke mempunyai kekuatan mampu mengeluarkan ameterasu yang bertujuan menghancurkan konoha yang telah membuat kakaknya membunuh keluarganya sendiri. Hokage Ketiga adalah guru dari 3 legenda sannin. Ia adalah Hokage yang terkenal sangat bijaksana dan juga pernah mengajarkan jurus yang digunakan untuk menyegel Kyubi pada Hokage Keempat. Dengan jurus itu Kyubi bisa disegel, dan dengan jurus itu Hokage bisa mengunci tangan Orochimaru ketika terjadi penyerbuan ke desa Konoha. Hokage Keempat adalah murid dari Jiraya, juga salah satu dari legenda sannin seperti Tsunade. Dialah yang bisa menyegel monster Kyubi ke dalam tubuh Naruto meskipun harus mengorbankan nyawanya sendiri. Ia adalah Hokage yang menciptakan Rasengan yang sekarang menjadi jurus andalan Naruto. Hokage Keempat adalah ayah dari Naruto itu sendiri. Ada desas desus / isu bahwa Hokage Keempat adalah Ketua Akatsuki. Meskipun begitu dia adalah orang yang sangat hebat. Yang terakhir adalah Tsunade atau Hokage Kelima, dia adalah salah satu dari 3 legenda sannin, meskipun umurnya sekitar 50 tahun tapi ketika melihatnya wajahnya seperti masih umur 20 tahunan. Saat ini belum ada cerita tentang Hokage Kedua, meskipun begitu Konoha akan terus bertekad menjadi sebuah desa besar yang sangat besar dan pencetak para ninja dan shinobi yang kuat dan memiliki hati dan budi yang luhur.Akatsuki dari desa ini adalah Tobi dan Itachi Uchiha
Tanigakure
Beberapa tiga puluh tahun sebelum seri awal, Tani no sato telah menandatangani armstice dengan Daun Tersembunyi setelah periode perang. Hidden Valley Desa pindah untuk menyerang dan menyapu habis desa melemah. Tidak ada informasi yang diketahui tentang status desa ini. Karena Nanafushi dikatakan berasal dari negara, ketimbang desa, mungkin Hidden Valley tidak lagi beroperasi.Otogakure
Sunagakure
Suatu ketika, para bangsawan Negara Angin, negara di mana desa ini berada, memutuskan untuk mengurangi anggaran militernya. Untuk menjaga agar desanya tetap kuat, Kazekage memutuskan untuk memperbaiki kualitas setiap ninja alih-alih menambah kuantitas prajuritnya. Gaara adalah salah satu produk dari keputusan tersebut.
Pengurangan anggaran ini ternyata tetap berdampak buruk bagi kekuatan militer Sunagakure. Banyak klien yang berpindah dan memilih untuk menyewa jasa ninja Konoha. Akibatnya, Kazekage berpendapat bahwa hal ini sangat mengancam eksistensi Suna. Ia pun beraliansi dengan Otogakure untuk menghancurkan Konoha sehingga klien dapat kembali memilih Suna. Namun penyerangan tersebut gagal akibat pengkhianatan Otogakure. Lebih jauh, Kazekage juga tewas. Hal ini menyebabkan Sunagakure balik beraliansi dengan Konoha. Dalam misi penyelamatan Sasuke, Sunagakure mengirim Gaara, Temari, dan Kankuro untuk membantu Konoha. Gaara kemudian menjadi Kazekage ke lima, menggantikan Kazekage sebelumnya yang tak lain adalah ayah dari Kankurou, Temari, dan Gaara.
Desa ini dominan terisi dengan pasir dan itu sangat menguntungkan Gaara, Kazekage sekaligus Jinchuuriki bijuu ekor satu, karena Gaara adalah seorang pengendali pasir. Desa ini tetap mendapat perhatian karena mempunyai ninja-ninja yang kuat. Akatsuki dari desa ini adalah Sasori.
Takumi no Sato
Takumi no Sato adalah sebuah desa fiktif di Anime & Manga Naruto. Desa pengarajin ini bukanlah sebuah desa shinobi resmi. Empat pengrajin terampil yang terlatih dalam seni ninja memakai karakter Takumi pada dahi mereka pelindung dan berusaha membangkitkan pendiri desa mereka, Seimei. Mereka berencana untuk menggunakan kebangkitan untuk membalas dendam terhadap Shinobi Besar Lima Desa, yang mereka merasa tidak menghargai desa mereka.Mereka beroperasi di bawah nama Shitenshounin, atau Empat Arah Surgawi. Nama ini berasal dari karakter dalam nama mereka sesuai dengan petunjuk dewa: Houki si Kura-Kura, Kujaku si Burung, Ryuugan si Naga dan Suiko si Macan.
Kemurigakure
Kemurigakure no Sato berarti "Desa Tersembunyi di Asap". Debutnya di chapter khusus team 7 yang ingin tahu di balik topeng Kakashi. Muncul 3 orang dari Kemurigakure untuk membunuh kakashi namun selalu gagal.Kirigakure
Kumogakure
Amegakure
Hoshigakure
Iwagakure
Soragakure
Soragakure no sato adalah desa fiktif di anime & manga Naruto. Soragakure no Sato berarti "desa tersembunyi di Langit" adalah latar dari Naruto the movie 5. Negara & desa ini memakai kecanggihan mesin terbang untuk ninja2nya. Negara ini pernah di kalahkan oleh Konohagakure. Di negara ini terdapat Ancor Vantian yang di ambil dari nama Angkor WatTakigakure
Tonbogakure
Tonbogakure berarti "Desa tersembunyi di antara Capung". Debutnya muncul di anime filler. Penghuni terakhirnya adalah Gennou yang menyusup sebagai kuli bangunan dari Suna.Kusagakure
Yugakure
Desa ini merupakan desa fiktif yang ada di dalam anime dan manga Naruto. Desa inilah yang hanya menganut agama Jashin adalah agama pemuja setan yang bersifat suka perkelahian. Selain itu, desa ini memiliki ninja Akatsuki yaitu Hidan. desa yugakure berada dia dalam negara singgaYukigakure
