Untuk melakukan jutsu, seorang ninja menggunakan chakra mereka. Dalam penjelasan berdasarkan suatu teks gulungan, Konohamaru menjelaskan bahwa chakra berasal dari dua hal :
- Mi/Raga. Yaitu Shintai Energi (Energi tubuh) yang berasal dari trilyunan sel-sel tubuh ninja
- Sei/Jiwa. Yaitu Seishin Energi (Energi mental dan spiritual) yang didapat dari latihan dan pengalaman.







